Danskeren gik i græsset efter en nærkamp med holdkammeraten Hrvoje Smolcic, og efter duellen med den kropsstærke kroat blev Lindstrøm liggende og signalerede smerter i anklen.
Det skriver de tyske medier Bild og Kicker, der begge overværede episoden.
Efter et par minutters behandling på den kolde bane blev Jesper Lindstrøm båret væk med støtte fra reservemålmand Jens Grahl og en ansat i klubben.
Det er uklart, hvad diagnosen er. Timingen er under alle omstændigheder ikke specielt gunstig for hverken Jesper Lindstrøm, Eintracht Frankfurt eller det danske landshold.
Onsdag i næste uge skal Frankfurt forsøge at vende 0-2 fra den første kamp mod Napoli til samlet sejr i Champions Leagues ottendedelsfinaler.
Dagen inden udtager landstræner Kasper Hjulmand sit hold til de forestående EM-kvalifikationskampe mod Finland og Kasakhstan. Landsholdet samles mandag 20. marts, og landskampene spilles i 23. og 26. marts.