Det oplyser klubben på sin hjemmeside.
Heartland overtager efter engelske Matthew Benham, der blev præsenteret som ny hovedaktionær i 2014.
Ni år senere har Benham solgt sine aktier til Heartland, som med et ejerskab på 95,5 procent bliver ny majoritetsaktionær i FC Midtjylland.
Heartland har også købt aktiemajoriteten i den portugisiske fodboldklub C.D. Mafra, som spiller i den næstbedste portugisiske række.
"Vi har været privilegerede under Matthews ejerskab, hvor vi er blevet en storklub i Danmark og har rykket os til at være blandt de 60 bedste hold i Europa", lyder det fra FCM-direktør Claus Steinlein.
"Nu kommer ejerskabet tilbage på danske hænder, og samtidig beholder vi adgangen til SmartOdds og de værktøjer, der har styrket organisationen indenfor data, analyse og rekruttering", fortsætter han.