Avisen Bild rapporterede, at den tidligere City-fløj Sane blev slået i ansigtet af den senegalesiske angriber og fik en flækket læbe efter tirsdagens nederlag.
"Sadio Mane vil ikke være med i FC Bayerns trup til hjemmekampen mod 1899 Hoffenheim næste lørdag," meddelte Bayern.
"Årsagen er Manes forseelse efter FC Bayerns Champions League-kamp mod Manchester City.
"Derudover vil Mane modtage en bøde," tilføjede de.
Bayern afviste anmodninger om at kommentere på skænderiet.
Bild rapporterede, at sammenstødet startede efter Bayerns nederlag i Manchester, hvor optagelser viser de to skændes på banen.
Mane og Sane blev set på træningsbanen tidligt i torsdags.
Nederlaget var Bayerns største Champions League-nederlag siden 2017.
De seksdobbelte europamestre har nu ikke meget håb om at vende resultatet i næste onsdags returopgør i München for at komme i semifinalen.
Mane har oplevet en frustrerende tid, siden han kom til de tyske mestre fra Liverpool i sommeren 2022.
Den dobbelte African Player of the Year-spiller scorede seks mål i sine første syv kampe i alle turneringer for Bayern, men har ikke scoret siden oktober.
Mane pådrog sig en skade i benet i november, hvilket holdt ham ude af Senegals VM i Qatar og fik ham til at gå glip af ni kampe for Bayern.