Teenageren Charlie Woods, som åbnede med en 82'er mandag, lavede en birdie, fire bogeys, to dobbeltbogeys og en trippelbogey og sluttede på 22 over par på 36 huller på Oakland Hills Country Club i forstaden Detroit.
Han sluttede i bunden af feltet på 264 golfspillere, 18 slag fra de 64 spillere, der nu har kvalificeret sig til matchplay-konkurrencen.
Tiger Woods gik rundt på banen og holdt øje med sin søn, men turneringsreglerne forhindrede ham i at fungere som Charlies caddie.
Vinderen af lørdagens 36-hullers finale får en plads i US Open på Oakmont i 2025.
Tiger Woods vandt US Junior Amateur i 1991, 1992 og 1993. Den eneste anden spiller, der har vundet mere end én gang, var Jordan Spieth i 2009 og 2011.
Den ældre og den yngre Woods har spillet sammen ved PNC Championship de seneste fire år og sluttede som nummer to i forældre-barn-turneringen i 2021.